La estructura de la Pastoral del Niño - Coordinación Nacional, de los Estados, Diócesis, Parroquias y Comunidades - es la más simple y ágil posible. Aproximadamente el 75% de los recursos son administrados directamente por los equipos regionales. Las Diócesis, pasan los recursos a los grupos parroquiales y las comunidades, para posibilitar el trabajo dedicado a la población necesitada. Las coordinaciones diocesanas rinden cuentas a la Coordinación Nacional que, concentrando la burocracia y descentralizando las actividades y los recursos, informatizó toda su actividad, permitiendo a las fuentes financieras el acceso inmediato a las informaciones sobre el alcance de los objetivos, la aplicación y uso de los recursos.

          Esta agilidad de la Pastoral del Niño es una herramienta importante para el suceso de sus acciones, permitiendo el acompañamiento de esos miles de niños y gestantes en todo el país a bajo costo.